Housemax Publicado en julio 13, 2016
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Tipo de empleo

Descripción

El Centro Internacional de la Papa (CIP) se encuentra en la búsqueda de un consultor con estudios de Doctorado en las especialidades de Biología Molecular o Ciencias Biologicas, que como parte de su labor se encuentre interesado(a) en desarrollar una tesis de doctorado dentro del Proyecto de Investigación Estratégica PNIA-IE-030-2015 Desarrollo de métodos de diagnóstico fitosanitario (DAS-ELISA, secuencia miento de fragmentos pequeños de RNA (sSRSA) y PCR) para incrementar la distribución, repatriación y uso de semillas de oca, olluco, mashua y yacón libres de virus.



La Consultoría: La consultoría se basará en Lima, Perú, teniendo entregables definidos dentro del proyecto PNIA-IE-030-2015.

Objetivo de la consultoría: Desarrollar métodos de diagnóstico fitosanitario basados en técnicas serológicas (ELISA), y moleculares (sSRSA y PCR), para la identificación de los principales virus que infectan la oca, el olluco, la mashua y el yacón, siendo los entregables los siguientes:

Extraer ARN viral usando la técnica de Trizol (Invitrogen) y determinar la calidad y concentración por espectrofotometría, en mil accesiones de oca, olluco, mashua y yacón.

Coordinar el secuencia miento a gran escala de pequeños fragmentos de ARN extraídos de las mil accesiones de oca, olluco, mashua y yacón.

Identificar genomas virales, parciales o completos, en las muestras de las mil accesiones de oca, olluco, mashua y yacón a través de diversas herramientas bioinformáticas.

Diseñar primers para la amplificación por PCR y verificar la eficiencia del método en la detección de los virus de mayor importancia en oca (PBRSV, AVB, PapMV y PVT), olluco (UVC, PLRV, AVA, UMV, TMV y APLV), mashua (TropMV y SoMV) y yacón (CMV).

Validar la nueva técnica de diagnóstico (basada en sSRSA y PCR) a través de la infección de un set de 10 plantas indicadoras (rango de huéspedes).

Determinar el estado fitosanitario, usando las técnicas de PCR validadas en el punto anterior, para 200 accesiones adicionales de oca, olluco, mashua y yacón conservadas in vitro en los bancos de germoplasma del CIP y del INIA.

Publicar dos artículos científicos en revistas científicas arbitradas y elaborar un manual sobre la tecnología sSRSA y PCR para el diagnóstico de virus en oca, olluco, mashua y yacón.
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